御坂美琴？初音未来？洛天（依）？我的天...学园都市，次元混乱。只是一名名少年少女，却面对着来自整座城市的黑暗！当然，光明与希望永在！
- 楔子——railgun超电磁炮
- 第一章——开学
- 第二章——惊艳
- 第三章——下午时光
- 第四章——公主殿下
- 第五章——市中心
- 第六章——无助与残忍
- 第七章——与所有黑暗为敌
- 第八章——我们注定是敌人
- 第九章——劫难后的欢笑
- 第十章——开启学院生活
- 第十一章——开学典礼前奏
- 第十二章——全校焦点
- 第十三章——她是我妹妹
- 第十四章——千秋夜
- 第十五章——霸气内定
- 第十六章——异能力实战
- 第十七章——双双秒杀
- 第十八章——第三轮对决
- 第十九章——苦战
- 第二十章——投影的灵感
- 第二十一章——放水
- 第二十二章——震惊
- 第二十三章——夜空下的漫步
- 第二十四章——妹妹
- 第二十五章——暗部第一杀手
- 第二十六章——心如乱麻
- 第二十七章——矢量反射
- 第二十八章——死亡
- 第二十九章——一方通行
- 第三十章——内心的痛
- 第三十一章——跌宕起伏
- 第三十二章（1）——突然而至
- 第三十二章（2）——突然而至
- 第三十三章——没有对手（回忆1）
- 第三十四章——Level EX计划（回忆2）
- 第三十五章（1）——克隆人造人
- 第三十五章（2）——克隆人造人
- 第三十六章（1）——第10032次实验（回忆3）